Comparative analyses of microbial genomic sequences can highlight genomic traits that may function as hallmarks of specific microbial lifestyles. In the July issue, Karpinets and colleagues report on coupling comparative genomics with metabolic network models to identify genomic traits associated with pathogenic versus mutualistic interactions with plants. These genomic hallmarks, which include a putative secretion system in pathogens and a putative RuBisCO-based metabolic pathway in mutualists, were successful in predicting the pathogenic versus mutualistic interactions of 20 recently sequenced microbes. View Article
Spanish translation courtesy of Diana Trujillo, University of Minnesota
Análisis comparativos de secuencias genómicas microbianas pueden resaltar rasgos genómicos que posiblemente funcionen para distinguir entre diversos estilos de vida de los microorganismos. En esta edición, Karpinets y sus colegas usaron técnicas de genómica comparativa conjunto con modelos de redes metabólicas para identificar rasgos genómicos asociados a interacciones patogénicas versus mutualistas con plantas. Usando estas características genómicas, que incluyen un sistema de secreción putativo en patógenos y una vía metabólica putativa basada en RuBisCO en mutualistas, fue posible predecir entre interacciones patogénicas y mutualistas en veinte microbios secuenciados recientemente.
Chinese translation courtesy of You Lu, University of Minnesota
微生物基因组序列的对比分析可以突显其基因组特征，这些特征可能作为微生物的特定生存方式的标志。在本月期刊中，Karpinets和同事结合比较基因组学和代谢网络模型的分析鉴定出了与植物致病性和与植物互利共生相关联的基因组特征。这些基因组的标志，其中包括一个在病原菌中潜在的分泌系统和一个在共生菌中潜在的基于RuBisCO 的代谢途径，成功地预测了近期被测序的20种微生物的致病性或互利共生相互作用。
